3DP-Jmol

3DP-Jmol

Automatizarea procesului de design

Looking for the english version? Have no fear, it is here.

Generarea modelului computerizat al moleculei reprezintă o etapă cheie, de care depinde atât reușita fabricării modelului fizic prin imprimare 3D, cât și succesul său ca material demonstrativ. Informații importante despre molecula țintă, precum dimensiunea, tipul și raza atomilor, lungimea legăturilor trebuie corelate cu dimensiunea fizică a modelului final. Pentru aceasta am dezvoltat 3DP-Jmol – un instrument ce automatizează procesul de generare a fișierelor tipăribile plecând de la date structurale.  
3DP-Jmol este în continuă dezvoltare și îmbunătățire.  De aceea e posibil să întâmpini dificultăți în utilizarea lui. Dacă însă ești destul de curajos, iată câțiva pasi simpli de urmat:

1. Descarcă și instalează JMol, o aplicație open-source pentru vizualizarea structurilor chimice în 3D;

2. Accesează link-ul 3DP-Jmol  și sub Assets vei găsi de descărcat fișierul  Source code (zip);

3. Descarcă fișierul, dezarhivează-l și deschide fișierul  3DP-JMol.v.xxxxx cu ajutorul unui editor de text;

4. Editează primele câmpuri indicate pentru a selecta molecula de tipărit și câteva detalii tehnice. Citește cu atenție explicațiile și editează doar ceea ce este necesar. 

5. Deschide aplicația Jmol instalată anterior și navighează în meniu astfel: File>Console….  Se va deschide o fereastră cu linia de comandă intitulată Console; 

6. Copie conținutul complet al fișierului editat în etapa 4 și lipește în linia de comandă folosind combinația de taste Ctrl-V (Cmd+V pentru Mac);

7. Așteaptă până JMol termină de generat fișierul tipăribil. Aceasta va fi semnalizată de apariția unui text similar cu cele de mai jos:
       OK 20527284 Stl /Users/mariusmihasan/test.stl
       Time for running the script version alfa.public is: 4956ms

8. Verifică instrucțiunile din fereastra intitulată Console și, dacă este nevoie, revin-o la etapa 4 și reia procesul. Calea către fișierul final pentru tipărit test.stl este indicat in penultima linie din fereastă. 

 

3DP-Jmol este dezvoltat prin contribuțiile urmăroarelor persoane:

  • Dr. Marius Mihasan, Biology Department, Alexandru Ioan Cuza University of Iasi, Carol I Bvd., No.11, 700506, Iaşi, Romania
  • Dr. Angel Herráez, Biochemistry and Molecular Biology, Dept. of Systems Biology, University of Alcalá, E-28805 Alcalá de Henares (Madrid), Spain (https://biomodel.uah.es/ 

Dezvoltarea 3DP-Jmol este suportată de  EDUMOL3D, Prouect PN-IV-P7-7.1-PED-2024-0343 finațat de UEFISCDI, Romania. Detalii aici.ile