Structura beta-pliată proteică

Description

Descriere

Modelul 3D al unei structuri beta-pliate  conținând aminoacizii 334 ADTWRIASYGTTPLSENWSVAPAMLAQRSKDRYADGDSYQWATFNLRLIQAINQ387, catena P dintr-o porină (PDB ID 1A0S) reprezentate în cele 3 modalități diferite de a vizualiza catena polipeptidică: cartoon, atomi și legături, suprafață moleculară. Atât în cazul modelului cartoon cât și a celui reprezentând atomii și legăturile covalente, au fost adăugate legăturile de H dintre atomii scheletului polipeptidic pentru a demonstra importanța acestora în stabilitatea acestei structuri secundare.

Context didactic

Modelul a fost creat pentru a facilita înțelegerea noținilor de structură secundară a proteinelor predate la cursul de Biochimie și a capitolelor de Biologie Structurală de la diverse alte cursuri. Modelul face parte dintre colecție esențială ce cuprinde  alfa-helix-ul proteic, structura beta pliată, lizozimul vizualizat ca și cartooon, hemoglobina, dublu helixul ADN și ARNt.

Instrucțiuni de tipărire

Material: PLA (acid polilactic).  Rezoluție: 0.2 mm. Scală: 350x, 250x pentru modelul suprafață moleculară
Modelele trebuie re-orintate în slicer pentru o tipărire optimă, iar noi am utilizat plugin-ul  Auto-orientation din Cura. Materialul suport este necesar și am utilizat Concetric supports in Cura. În etapa de finalizare unele catene laterale s-au rupt, dar au putut fi lipite.